1、采食量严重下降，鸡群生长发育严重受阻。有的肉鸡群十天左右发病，一直至四十天出栏都采食跟不上，不能及时出栏。蛋鸡群则会影响产蛋率及鸡群体重。
2、鸡群均匀度严重下降，出现祖孙三代鸡现象。
3、影响鸡群免疫力最终表现抗病力下降，易诱发气囊炎及病毒病。
4、带来一系列肠道问题，表现排便细，有的地区养殖户形容鸡排“面条粪”，粪便发黄，含大量未消化饲料，鸡群消化力吸收率下降，严重影响料肉比。造成巨大损失。
诱发腺肌胃炎的因素
1、饲料霉菌毒素问题，这一点已经广为行业认可，并且已经有人用添加霉菌毒素污染的饲料复制出腺肌胃炎的病例
2、鸡舍内部环境，统计表明，高温高湿环境更易诱因腺肌胃炎的发生。而通风较好的鸡舍相对发病率低。
3、遗传性因素也会增加本病的发生率，但一般小规模养殖场很难排除本病。
从管理上防控腺肌胃炎要素一:控料净槽分批给料：
控料自进鸡1日龄起，改掉以往的全天喂料自由采食的习惯，每天少喂勤添，1-3日龄，将全天加料量分六次添加，鸡群采食完后，争取有两个小时以上的空料时间。自4日龄起，每天添料四次。要素二:避免高温高湿育雏：
前两天控制在32-33摄氏度，以后每天再慢慢下调。育雏温度尽量不超过33度，湿度则保持在正常范围内。要素三:添加脱霉剂：
雏鸡料自进雏起就添加脱霉剂，如霉可清，而不是用治疗腺肌胃炎的药物来长期预防。
要素四：控光：
同时，自8日龄起，晚上24点起停止光照1小时；9日龄停光2小时；10日龄停光3小时；11日龄停光4小时；12日龄起-40日龄，停光照时间恒定为5小时。此方案经两年多的观察总结，可有效减少腺肌胃炎的发病率。当地市场严格执行此方案的养鸡场，极少发生腺肌胃炎。
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